优势专业建设。建立以品牌专业为龙头、以特色专业为重点、以优势学科为支撑的专业群，辐射带动全校专业建设。依托现有的省级重点学科、硕士点与博士点、省部级重点实验室和研究中心，已建成国家特色专业6个，湖北省品牌专业11个，湖北省普通高等学校战略性新兴（支柱）产业计划专业9个；建设国家级专业综合改革试点专业1个，省部级专业综合改革试点专业6个；建设教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业6个，“卓越医生教育培养计划”试点专业1个，“卓越农林人才教育培养计划”项目2个，“荆楚卓越人才”协同育人计划项目3个。在优势与特色专业中组建各种形式的实验班50余个。
新办专业建设。依据 《长江大学专业建设管理办法》，学校设立严格的专业准入条件，增设新专业必须进行科学论证，并具备必需的基本条件。学校资助每个新办专业10～15万元专项建设经费，按照 《长江大学新办本科专业办学水平合格评价标准》 进行中期检查和评审验收。2010年以来，学校依托相近或相关优势学科专业，新增 16 个本科专业，新增专业师资队伍、实验实践等办学条件有保障。学生对新办专业课堂教学质量的评价、督导专家随堂听课的结果表明，新办专业教学质量优良，其设置优化了专业布局，扩大了服务面向，增强了办学活力。